SEM 파일 처리

Gatan 사의 전자현미경으로 뭘 찍고 저장하면 dm3 파일형식으로 저장하게 되는데, 이걸 읽어오려면 전자현미경 회사에서 준 정품(?) 프로그램을 쓰든지, 아니면 다른 오픈소스 프로그램을 이용할 수 있다.

http://blake.bcm.edu/emanwiki/EMAN2/Install/BinaryInstall

EMAN이라는 프로그램을 써야 하는 것 같다. 이게 근데 파이썬 프로그램이다보니 설치가 꼬여서 포기. 난 이래서 파이썬이 싫다. 내가 프로그램 만들기는 쉽지만 누굴 줘서 쓰게 하려면 나도 삽질 그쪽도 삽질...

자바는 더 싫어하긴 하지만, 그래도 이쪽은 일단 자바 런타임을 설치해 두면 쉽긴 하니까.

http://imagej.nih.gov/ij/

여기서 설치한다.

그냥 설치만 하면 dm3 파일을 읽어오지 못하는데 (그냥 까만 화면만 나옴)

http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=faq:general:which_file_formats_are_supported_by_imagej

여기서 보니 dm3 파일을 지원한다고 해서 찾아들어가 보니,

http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/DM3_Reader.html

어느 친절하신 분이 개발한 dm3 플러그인을 설치하면 된다. 이 플러그인은 Class 파일을 다운받아서 ImageJ 파일들이 있는 디렉토리의 plugin 디렉토리에 넣고 ImageJ를 다시 실행시키면 된다.

이 모든 정보는

http://cryoem.ucsd.edu/microscopes/DM3.shtm

여기서 알 수 있었다.